Több webhelyen való telepítéskor a WooCommerce ugyanúgy viselkedik, mint a legtöbb más bővítmény. A hálózat egyes webhelyei – bár közös adatbázist használnak – különálló táblákban tárolják az adatokat. Így minden áruház külön konfigurációnak minősül.
Bár aktiválhatjuk hálózaton belül a bővítményeket (például a WooCommerce-t és annak bővítményeit), ilyenkor nem lehet megosztani termékadatbázisokat, megrendelési adatokat, valamint a felhasználói fiókok adatait a hálózat különböző webhelyein.
Csak a sablonok és a bővítmények megosztása történik meg a webhelyek hálózatában.